وتشمل برامج الماجستير المتاحة تخصصات في كلية الطب (ماجستير التعليم الطبي)، وكلية الصحة العامة والمعلوماتية الصحية ( ماجستير المعلوماتية الصحية، ماجستير الصحة العامة في إدارة الأنظمة الصحية، وماجستير الصحة العامة في الوبائيات والإحصاء الحيوي، ماجستير الصحة العامة)، وكلية الصيدلة (ماجستير اكتشاف الأدوية وتطويرها)، وكلية العلوم الطبية التطبيقية (الماجستير التنفيذي في مخاطر المواد الصناعية والإشعاعية)، بالإضافة إلى كلية التمريض (ماجستير التمريض – تخصص القبالة).